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【2026年完整版:分子对接全流程完整学习实操指南】零基础搞定分子对接|AutoDock Vina安装+对接+可视化+批量筛选全攻略

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2026-08-26 10:39:54
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🔬 AutoDock Vina 分子对接完整实操教程|从软件安装到发表级结果图,一套课全掌握! 分子对接是计算机辅助药物设计(CADD)的核心技术。本教程带你手把手实操,从零基础到独立完成分子对接全流程,拒绝纯理论,每一步都有可直接复制的命令! 📌 本教程涵盖 14 章系统内容: ✅ 分子对接核心概念与应用场景 ✅ AutoDock Vina 算法与打分函数详解 ✅ Windows/Linux/macOS 全平台安装配置 ✅ PDB/PDBQT/SDF/SMILES 文件格式精讲 ✅ 受体蛋白准备(去水、加氢、加电荷、PDBQT转换) ✅ 配体分子准备(PubChem下载、SMILES转3D、Meeko质子化) ✅ 对接盒设置(活性位点定位、坐标计算、参数选择) ✅ 对接运行与日志解读(结合能、RMSD、构象分析) ✅ 结果可视化(PyMOL/Discovery Studio 作图、2D相互作用图) ✅ 批量虚拟筛选(Python/Shell 并行脚本,一键筛选数千化合物) ✅ 柔性对接(侧链残基自由旋转,提高精度) ✅ 完整实战案例(SARS-CoV-2 Mpro 与抑制剂对接全流程) ✅ 常见问题排错与性能优化 ✅ 工具与资源汇总(软件下载、数据库、在线工具) 💻 附带完整代码:Bash 批量对接脚本 + Python 自动化准备/结果汇总脚本,开箱即用! 🎯 适合人群: 药学/化学/生物学/医学相关专业学生、科研人员、CADD初学者,以及所有想入门分子对接的伙伴。 一键三连,开启你的分子对接进阶之路!🚀 关键词 AutoDock Vina、分子对接、虚拟筛选、CADD、计算机辅助药物设计、受体准备、配体准备、PDBQT、分子动力学、结合能、RMSD、柔性对接、批量筛选、PyMOL、Discovery Studio、SARS-CoV-2 Mpro、药物发现、先导化合物、打分函数、分子可视化、OpenBabel、Meeko、Smina、Linux命令行、Python脚本、蛋白质结构、小分子抑制剂。
主要内容和方向:天然产物/作物遗传育种/植物/代谢组学/质谱研究/AI应用/生信/多组学/计算化学
视频选集
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第01集-分子对接概述
11:27
第02集-AutoDock Vina 简介
10:54
第03集-软件安装与配置
12:20
第04集-文件格式详解
12:12
第05集-受体蛋白准备
13:10
第06集-配体分子准备
13:06
第07集-对接盒设置
13:54
第08集-运行分子对接
12:44
第09集-结果分析与可视化
13:00
第10集-批量虚拟筛选
13:26
第11集-柔性对接
12:56
第12集-完整实战案例
13:16
第13集-常见问题排错
12:41
第14集-工具与资源汇总
12:15
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