🔬 AutoDock Vina 分子对接完整实操教程|从软件安装到发表级结果图,一套课全掌握!
分子对接是计算机辅助药物设计(CADD)的核心技术。本教程带你手把手实操,从零基础到独立完成分子对接全流程,拒绝纯理论,每一步都有可直接复制的命令!
📌 本教程涵盖 14 章系统内容:
✅ 分子对接核心概念与应用场景
✅ AutoDock Vina 算法与打分函数详解
✅ Windows/Linux/macOS 全平台安装配置
✅ PDB/PDBQT/SDF/SMILES 文件格式精讲
✅ 受体蛋白准备(去水、加氢、加电荷、PDBQT转换)
✅ 配体分子准备(PubChem下载、SMILES转3D、Meeko质子化)
✅ 对接盒设置(活性位点定位、坐标计算、参数选择)
✅ 对接运行与日志解读(结合能、RMSD、构象分析)
✅ 结果可视化(PyMOL/Discovery Studio 作图、2D相互作用图)
✅ 批量虚拟筛选(Python/Shell 并行脚本,一键筛选数千化合物)
✅ 柔性对接(侧链残基自由旋转,提高精度)
✅ 完整实战案例(SARS-CoV-2 Mpro 与抑制剂对接全流程)
✅ 常见问题排错与性能优化
✅ 工具与资源汇总(软件下载、数据库、在线工具)
💻 附带完整代码:Bash 批量对接脚本 + Python 自动化准备/结果汇总脚本,开箱即用!
🎯 适合人群:
药学/化学/生物学/医学相关专业学生、科研人员、CADD初学者,以及所有想入门分子对接的伙伴。
一键三连,开启你的分子对接进阶之路!🚀
关键词
AutoDock Vina、分子对接、虚拟筛选、CADD、计算机辅助药物设计、受体准备、配体准备、PDBQT、分子动力学、结合能、RMSD、柔性对接、批量筛选、PyMOL、Discovery Studio、SARS-CoV-2 Mpro、药物发现、先导化合物、打分函数、分子可视化、OpenBabel、Meeko、Smina、Linux命令行、Python脚本、蛋白质结构、小分子抑制剂。