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【单细胞合集2】单细胞数据的标准化、去批次及降维

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2024-09-20 11:30:49
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用相对简单的方法,向大家展示单细胞分析的整了流程。祝大家多发顶刊
代码数据都在交流群,加群/分析请私信:ZhZSdsHe_Zcy。
单细胞专题
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简介
【单细胞专题1】多种类型单细胞数据读取(10X、h5、csv、txt)分析及质控
06:17
【单细胞专题2】数据的标准化、去批次及降维
06:35
【单细胞专题3】SingleR单细胞注释
05:06
【单细胞专题4】人工手动单细胞注释
08:55
【单细胞合集5】单细胞细胞通讯分析(CellChat)代码及示例数据
07:51
【单细胞合集6】单细胞拟时序分析(monocle2)代码及示例数据
07:29
【单细胞合集7】单细胞hdWGCNA分析代码及示例数据
08:47
【单细胞合集8】单细胞InferCNV分析(高分必备)代码及示例数据
05:47
【单细胞合集9】单细胞自定义基因集评分/打分(AddModuleScore)
04:54
【单细胞合集10】单细胞AUCell基因集评分/打分代码及示例数据
04:59
【单细胞合集11】单细胞细胞比例图代码及示例数据
02:10
【单细胞合集12】单细胞GSVA富集分析代码急示例数据
02:34
【单细胞合集13】单细胞火山图鉴别差异基因代码加示例数据
03:00
【单细胞合集14】单细胞桑基图代码及示例数据
02:27
【单细胞合集15】单细胞正常组和疾病组差异分析
04:25
【单细胞合集16】单细胞亚群提取再注释
03:33
【单细胞专题17】Seurat V4和V5共存和转换
01:42
【单细胞合集18】scTenifoldKnk—基因虚拟敲除
02:05
【单细胞合集19】单细胞亚群最全富集通路分析KEGG/Hallmark/Reactome
03:13
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