本研究针对单域抗体因缺失Fc片段而难以进行标准蛋白A亲和层析纯化的挑战,提出了TFDesign-sdAb深度学习框架。该系统整合了结构感知扩散模型IgGM与亲和力排序模型A2binder,核心创新在于实现了对单域抗体框架区(FR)的精准重构,而非传统的CDR区优化。实验结果显示,该方法在不损害抗原结合能力的前提下,赋予了抗体与蛋白A结合的新功能,设计精度达到1.49Å,在复合体预测表现上显著优于AlphaFold-3。通过高分辨率晶体结构验证,AI生成的结合位点准确模拟了天然交互模式。该研究为低成本、自动化的抗体工程提供了普适性方案,有效提升了单域抗体的生产性与转化潜力。