一、NCBI
二、PrimerBank
三、文献+Blast验证
引物设计原则:
1、 引物的长度一般在18-24碱基之间,扩增产物的长度一般在80-250bp之间,控制在80-150bp最佳。
2、 GC含量在40%-60%之间(太高不容易打开,效率低)
3、 引物的Tm值在55-65℃度左右,正反不能相差太大(3℃),相差越小越好。
4、 引物的3‘端不能是A,最好选择T。碱基要随机分布,最好不要有3个连续的碱基出现。
5、 Self complementarity最好在0-3之间,Self 3‘ complementarity小于1/4碱基数,越低越好,越小越不容易形成发卡结构或其它二级结构。
6、 引物需要跨外显子。